Kilar sáng tác cho dàn nhạc giao hưởng, nhạc thính phòng và tác phẩm cho các nhạc cụ độc tấu. Tháng 1 năm 2001, thế giới chứng kiến buổi ra mắt Missa pro pace của ông. Ông sáng tác cho một dàn nhạc giao hưởng với đầy đủ dàn hợp xướng và một nhóm nghệ sĩ độc tấu tại National Philharmonic ở Warsaw. Tác phẩm được viết để kỷ niệm một trăm năm của Warsaw Philharmonic. Vào tháng 12 năm 2001, bản nhạc đã được trình diễn một lần nữa trong Hội trường Paul VI trước sự chứng kiến của Giáo hoàng John Paul II.[14] Tác phẩm Angelus năm 1984 của ông được sử dụng trong bộ phim hành động City of Angels; Orawa, từ năm 1988, đã tìm thấy việc sử dụng nó trong sản phẩm năm 2003 của Santa Clara Vanguard, "Pathways".

Trong phần lớn cuộc đời của mình, các tác phẩm của Kilar bị chi phối bởi nhạc phim với một loạt các tác phẩm âm nhạc đơn giản nhưng phát hành đều đặn. Năm 2000, ông chuyển sang "âm nhạc của một nhà soạn nhạc phi thường". Kể từ Bản giao hưởng tháng 9 năm 2003, (Bản giao hưởng số 3), một bản giao hưởng quy mô đầy đủ bốn phong trào được viết cho người bạn của nhà soạn nhạc Antoni Wit, Kilar trở lại với âm nhạc thuần túy. Bản giao hưởng tháng 9 là bản giao hưởng đầu tiên của nhà soạn nhạc kể từ Bản giao hưởng dành cho đàn dây năm 1955 (cùng với một bản giao hưởng sinh viên khác) và Kilar coi đó là bản giao hưởng trưởng thành đầu tiên của mình (sáng tác ở tuổi 71).

Từ năm 2003, Kilar đã liên tục sản xuất các tác phẩm âm nhạc với quy mô lớn. Ca khúc Lament (2003) dành cho dàn hợp xướng, Bản giao hưởng số 4 Sinfonia de Motu (Bản giao hưởng chuyển động) từ năm 2005 được viết cho dàn nhạc lớn, hợp xướng và độc tấu, Thánh lễ Magnificat của ông từ năm 2006, Bản giao hưởng số 5 Advent, Te Deum được công chiếu vào tháng 11 năm 2008 [8] Kilar nói rằng ông tin rằng mình đã phát hiện ra hòn đá giả kim của các nhà triết học, và cho rằng "không có gì đẹp hơn âm thanh đơn độc hay sự hòa hợp tồn tại mãi mãi, rằng đây là sự khôn ngoan sâu sắc nhất, không giống như những mánh khóe của chúng ta với sonata, fugues, và hòa âm. " Các tác phẩm của Kilar đã được thực hiện bởi một số dàn nhạc quốc tế lớn, bao gồm Dàn nhạc Philadelphia, Dàn nhạc Cleveland, và Dàn nhạc giao hưởng New York.